Pada periode tahun 2022-2026, susunan fungsionaris Fakultas Filsafat Universitas Katolik Santo Thomas adalah sebagai berikut:
Dekan : Dr. Laurentius Tinambunan
Wakil Dekan I : Dr. Fransiskus Xaverius Marmidi
Wakil Dekan II : Dr. Hieronymus Simorangkir
Wakil Dekan III : Surip Stanislaus, Lic. S.Th.
Ketua Program Studi Ilmu Filsafat (S-1) : Dr. F.X. Marmidi
Ketua Program Studi Magister Ilmu Filsafat (S-2): Dr. Asrot Purba
Adapun, struktur organisasi Fakultas Filsafat adalah sebagai berikut: